炭疽菌（Colletotrichum）是囊菌（Ascomycota）的属，种类繁多。它们是全球公认的许多野生植物和大多数栽培植物物种的病原体。这些生物攻击热带和亚热带地区的农作物，给农业产业造成数百万美元的损失。
炭疽菌属的真菌负责收获后的水果腐烂，炭疽病和对重要商业植物的枯萎病，这些重要植物包括香蕉，木瓜，木薯，高粱，咖啡，豆类，番茄，辣椒等。
炭疽菌。取自并编辑自http://www.padil.gov.au/maf-border/pest/main/143016/51031
炭疽菌物种的分类学分类是有争议的，目前正在审查中。一些形态特征可用于区分物种组，但在其他情况下则无用。
已建议炭疽菌属含有彼此密切相关的隐性物种复合物，具有相似的定植和感染行为。
特点
炭疽菌是子囊真菌的一部分。这些生物的特征在于呈现出囊状的生殖结构。它的菌丝体由分隔的菌丝组成。
一般而言，子囊菌，尤其是炭疽菌的其他特征是：
分生孢子无性繁殖
有性生殖总是涉及具有两个或多个单倍体子囊孢子的子囊的产生。它们可以承受10至40°C的温度，但它们的最佳显影温度为28°C。
在感染过程中，炭疽菌属的植物致病物种最初定植在植物的活细胞中，破坏了细胞壁，但没有穿透这些细胞的质膜（这防止了进行性细胞死亡）。
真菌开始喂食植物的死亡部分与后者的形态，遗传和生理变化有关。真菌中的这些变化导致大量细胞死亡和宿主组织破坏。
炭疽菌引起的炭疽病。摘自http://fomesa.net/Calidad/Variedades/img/P_Colle_02.jpg
分类
科尔迪奥属（Colletotrichum）属科达（Corda）在1831年建立，以描述C. lineola物种为基础，该物种基于在布拉格（捷克共和国）从A虫科不明身份的草本植物的茎中收集的材料。
目前，尽管Colletotrichum属被认为是有效的，但不同物种的定义仍存在争议，并有待修订。
该属的某些种类与鞘孢菌属的种类混淆，但是后者在子宫颈中不产生蘑菇。
分类鉴定
形态学
在某些物种中，基于炭疽菌真菌的形态特征，基于与它们相关的宿主，菌丝体生长，孢子形成能力以及分生孢子，附睾和菌核的特殊特征，可以进行鉴定。
为此，有必要进行真菌的人工培养并观察分生孢子的萌发。
分子
传统上已使用形态学特征和寄主范围来定义真菌物种。过度和不适当地使用宿主类型来确定物种，导致不必要的科学名称泛滥。
这可能部分是由于以下事实：空间分布广泛的植物物种可能会受到不同真菌物种的影响。造成这种情况的另一个原因是，一些炭疽菌物种可能与单一植物物种相关联，而另一些物种可能与不止一个宿主相关联。
由于上述原因，分子生物学作为一种工具已经提供了有关这一类真菌的系统学的新知识，尤其是在物种定界以及种间和种内关系的定义方面。
核糖体RNA（ITS）的内部可转录间隔区是最常用于区分真菌的区域。事实证明，该区域在区分炭疽菌物种中几乎没有用。
多基因座系统发育已被广泛应用于鉴定该属的物种。使用这种方法已表明，C。gloeosporioides实际上是由23个分类单元组成的复合体。基于多基因座系统发育，已经描述了至少19个新物种。
其他工具
其他建议的工具可以帮助阐明炭疽菌的种类，包括生化和生理分析。
形态学
当科尔达（Corda）在1831年描述了炭疽菌（C. lineola）的第一个物种时，他提到该物种形成线性纺锤形的小孢子，它们呈弯曲的外观，透明分生孢子的透明分生孢子，具刚毛和刚毛科。次要的和尖锐的尖端。
通常，炭疽菌属的真菌具有位于表皮上或附近，不规则开放的闭合的，刚毛，垫形的无性子实体。
基底基质的厚度可变，深棕色至无色或几乎无色。基底基质细胞是多面体，直径几乎相同，并且它们之间没有间隔。
在PDA上培养的炭疽菌菌落；C. gloeosporioides组1（a）; 第2（b）组；第3（c）组；墨角藻（d。元宝枫（e）。摘自http://www.fungaldiversity.org/fdp/sfdp/18-9.pdf
炭疽病引起的
这种状况，也称为叶子上的黑斑病，是由各种真菌引起的。有时很难确定引起特定攻击的真菌的属和种。
由秋水仙引起的炭疽病在苗圃植物和许多农作物中非常普遍。这种病会影响叶子，树枝，花朵和果实。炭疽病的主要炭疽菌物种属于C. gloeosporioides物种的复合体。
由于苗圃中炭疽菌引起的炭疽病，叶斑病是最常见的生产损失原因。该病还可能表现为叶子上的枯萎病，茎，枝或花上的斑点，茎和枝上的溃疡或果实腐烂。症状的表达高度依赖于被感染的植物种类。
炭疽菌对植物产生的经济损害通常是由于田间或收获后果实腐烂而造成损失的结果。这种疾病造成了17％的木瓜作物，30％的芒果和多达50％的辣椒作物的损失。
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